Detalles de la búsqueda
1.
Landscape and function of multiple mutations within individual oncogenes.
Nature
; 582(7810): 95-99, 2020 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32494066
2.
Improving Compound-Protein Interaction Prediction by Self-Training with Augmenting Negative Samples.
J Chem Inf Model
; 63(15): 4552-4559, 2023 08 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37460105
3.
VGAE-MCTS: A New Molecular Generative Model Combining the Variational Graph Auto-Encoder and Monte Carlo Tree Search.
J Chem Inf Model
; 63(23): 7392-7400, 2023 Dec 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37993764
4.
Oncogenic mutations Q61L and Q61H confer active form-like structural features to the inactive state (state 1) conformation of H-Ras protein.
Biochem Biophys Res Commun
; 565: 85-90, 2021 08 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34102474
5.
Structure-Based de Novo Molecular Generator Combined with Artificial Intelligence and Docking Simulations.
J Chem Inf Model
; 61(7): 3304-3313, 2021 07 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34242036
6.
E487K-Induced Disorder in Functionally Relevant Dynamics of Mitochondrial Aldehyde Dehydrogenase 2.
Biophys J
; 119(3): 628-637, 2020 08 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32681823
7.
Molecular Basis for Allosteric Inhibition of GTP-Bound H-Ras Protein by a Small-Molecule Compound Carrying a Naphthalene Ring.
Biochemistry
; 57(36): 5350-5358, 2018 09 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30141910
8.
In silico discovery of small-molecule Ras inhibitors that display antitumor activity by blocking the Ras-effector interaction.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(20): 8182-7, 2013 May 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23630290
9.
Developing a GNN-based AI model to predict mitochondrial toxicity using the bagging method.
J Toxicol Sci
; 49(3): 117-126, 2024.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38432954
10.
A macrocyclic kinase inhibitor overcomes triple resistant mutations in EGFR-positive lung cancer.
NPJ Precis Oncol
; 8(1): 46, 2024 Feb 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38396251
11.
Quantitative analysis of protein dynamics using a deep learning technique combined with experimental cryo-EM density data and MD simulations.
Biophys Physicobiol
; 20(2): e200022, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38496243
12.
Enhanced Conformational Sampling with an Adaptive Coarse-Grained Elastic Network Model Using Short-Time All-Atom Molecular Dynamics.
J Chem Theory Comput
; 18(4): 2062-2074, 2022 Apr 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35325529
13.
Integrated approach to functional analysis of an ERBB2 variant of unknown significance detected by a cancer gene panel test.
Cell Oncol (Dordr)
; 45(1): 121-134, 2022 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34997908
14.
Novel Calcium-Binding Ablating Mutations Induce Constitutive RET Activity and Drive Tumorigenesis.
Cancer Res
; 82(20): 3751-3762, 2022 10 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36166639
15.
Exploring ligand binding pathways on proteins using hypersound-accelerated molecular dynamics.
Nat Commun
; 12(1): 2793, 2021 05 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33990583
16.
Machine learning to estimate the local quality of protein crystal structures.
Sci Rep
; 11(1): 23599, 2021 12 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34880321
17.
Microsecond-timescale MD simulation of EGFR minor mutation predicts the structural flexibility of EGFR kinase core that reflects EGFR inhibitor sensitivity.
NPJ Precis Oncol
; 5(1): 32, 2021 Apr 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33863983
18.
Improvement in predicting drug sensitivity changes associated with protein mutations using a molecular dynamics based alchemical mutation method.
Sci Rep
; 10(1): 2161, 2020 02 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32034220
19.
Solution structure of the variable-type domain of the receptor for advanced glycation end products: new insight into AGE-RAGE interaction.
Biochemistry
; 47(47): 12299-311, 2008 Nov 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19032093
20.
Structural basis for intramolecular interaction of post-translationally modified H-Rasâ¢GTP prepared by protein ligation.
FEBS Lett
; 591(16): 2470-2481, 2017 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28730604